Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5DP30049 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms