Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCAP28676 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCAP28676 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCAP28676 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCAP28676 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCAP28676 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCAP28676 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCAP28676 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCAP28676 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCAP28676 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCAP28676 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCAP28676 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCAP28676 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCAP28676 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GCAP28676 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GCAP28676 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCAP28676 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GCAP28676 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCAP28676 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCAP28676 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCAP28676 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCAP28676 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCAP28676 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCAP28676 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCAP28676 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCAP28676 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCAP28676 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCAP28676 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCAP28676 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCAP28676 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCAP28676 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCAP28676 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCAP28676 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCAP28676 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCAP28676 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCAP28676 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCAP28676 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCAP28676 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCAP28676 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCAP28676 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCAP28676 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCAP28676 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCAP28676 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCAP28676 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCAP28676 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCAP28676 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCAP28676 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCAP28676 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCAP28676 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCAP28676 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCAP28676 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCAP28676 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GCAP28676 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCAP28676 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCAP28676 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCAP28676 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCAP28676 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCAP28676 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCAP28676 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCAP28676 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCAP28676 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCAP28676 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCAP28676 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCAP28676 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCAP28676 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCAP28676 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCAP28676 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCAP28676 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCAP28676 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCAP28676 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCAP28676 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCAP28676 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCAP28676 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCAP28676 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCAP28676 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCAP28676 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCAP28676 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCAP28676 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GCAP28676 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCAP28676 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCAP28676 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCAP28676 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCAP28676 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCAP28676 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCAP28676 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GCAP28676 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCAP28676 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCAP28676 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCAP28676 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCAP28676 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCAP28676 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCAP28676 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCAP28676 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCAP28676 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GCAP28676 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCAP28676 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCAP28676 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCAP28676 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCAP28676 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCAP28676 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms