Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms