Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
APCP25054 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
APCP25054 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
APCP25054 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
APCP25054 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
APCP25054 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
APCP25054 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
APCP25054 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
APCP25054 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
APCP25054 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
APCP25054 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
APCP25054 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
APCP25054 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
APCP25054 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
APCP25054 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
APCP25054 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
APCP25054 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
APCP25054 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
APCP25054 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
APCP25054 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
APCP25054 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
APCP25054 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
APCP25054 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
APCP25054 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.04
APCP25054 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
APCP25054 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
APCP25054 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
APCP25054 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
APCP25054 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
APCP25054 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
APCP25054 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
APCP25054 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
APCP25054 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
APCP25054 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.04
APCP25054 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
APCP25054 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
APCP25054 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
APCP25054 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
APCP25054 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
APCP25054 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
APCP25054 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
APCP25054 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
APCP25054 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
APCP25054 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
APCP25054 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
APCP25054 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
APCP25054 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
APCP25054 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
APCP25054 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
APCP25054 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
APCP25054 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
APCP25054 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
APCP25054 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
APCP25054 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
APCP25054 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
APCP25054 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
APCP25054 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
APCP25054 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
APCP25054 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
APCP25054 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
APCP25054 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
APCP25054 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
APCP25054 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
APCP25054 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
APCP25054 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
APCP25054 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
APCP25054 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
APCP25054 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
APCP25054 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
APCP25054 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
APCP25054 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
APCP25054 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
APCP25054 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
APCP25054 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
APCP25054 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
APCP25054 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
APCP25054 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
APCP25054 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
APCP25054 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
APCP25054 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
APCP25054 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
APCP25054 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
APCP25054 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
APCP25054 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
APCP25054 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
APCP25054 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
APCP25054 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
APCP25054 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
APCP25054 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
APCP25054 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
APCP25054 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
APCP25054 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APCP25054 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
APCP25054 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
APCP25054 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
APCP25054 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
APCP25054 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APCP25054 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APCP25054 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
APCP25054 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms