Protein–RNA interactions for Protein: P24941

CDK2, Cyclin-dependent kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK2P24941 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK2P24941 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK2P24941 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK2P24941 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK2P24941 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK2P24941 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK2P24941 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK2P24941 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK2P24941 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2P24941 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2P24941 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2P24941 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2P24941 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2P24941 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2P24941 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2P24941 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2P24941 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2P24941 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2P24941 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2P24941 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2P24941 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2P24941 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2P24941 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2P24941 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2P24941 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2P24941 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2P24941 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2P24941 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2P24941 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2P24941 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2P24941 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2P24941 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2P24941 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2P24941 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2P24941 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2P24941 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2P24941 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2P24941 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2P24941 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2P24941 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2P24941 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2P24941 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2P24941 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2P24941 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2P24941 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2P24941 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2P24941 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2P24941 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK2P24941 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK2P24941 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK2P24941 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK2P24941 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK2P24941 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK2P24941 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK2P24941 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK2P24941 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK2P24941 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK2P24941 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK2P24941 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK2P24941 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK2P24941 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK2P24941 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK2P24941 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK2P24941 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK2P24941 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK2P24941 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK2P24941 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK2P24941 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK2P24941 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK2P24941 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK2P24941 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK2P24941 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK2P24941 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK2P24941 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK2P24941 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK2P24941 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK2P24941 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK2P24941 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK2P24941 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK2P24941 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK2P24941 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK2P24941 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK2P24941 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK2P24941 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK2P24941 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK2P24941 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK2P24941 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK2P24941 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK2P24941 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK2P24941 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK2P24941 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK2P24941 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK2P24941 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK2P24941 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK2P24941 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK2P24941 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK2P24941 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK2P24941 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK2P24941 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK2P24941 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms