Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HRCP23327 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
HRCP23327 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HRCP23327 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HRCP23327 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
HRCP23327 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
HRCP23327 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HRCP23327 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HRCP23327 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HRCP23327 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HRCP23327 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HRCP23327 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HRCP23327 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HRCP23327 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HRCP23327 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HRCP23327 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HRCP23327 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HRCP23327 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HRCP23327 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HRCP23327 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
HRCP23327 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
HRCP23327 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HRCP23327 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HRCP23327 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HRCP23327 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HRCP23327 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HRCP23327 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HRCP23327 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HRCP23327 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HRCP23327 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HRCP23327 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HRCP23327 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HRCP23327 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HRCP23327 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
HRCP23327 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HRCP23327 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HRCP23327 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HRCP23327 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HRCP23327 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HRCP23327 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HRCP23327 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
HRCP23327 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HRCP23327 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HRCP23327 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HRCP23327 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HRCP23327 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HRCP23327 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
HRCP23327 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HRCP23327 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
HRCP23327 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HRCP23327 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HRCP23327 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HRCP23327 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
HRCP23327 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
HRCP23327 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HRCP23327 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HRCP23327 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HRCP23327 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HRCP23327 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HRCP23327 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HRCP23327 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HRCP23327 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HRCP23327 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HRCP23327 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HRCP23327 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HRCP23327 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HRCP23327 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HRCP23327 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HRCP23327 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HRCP23327 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HRCP23327 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HRCP23327 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HRCP23327 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HRCP23327 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
HRCP23327 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HRCP23327 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HRCP23327 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HRCP23327 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HRCP23327 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HRCP23327 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HRCP23327 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HRCP23327 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HRCP23327 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
HRCP23327 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HRCP23327 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HRCP23327 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HRCP23327 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
HRCP23327 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HRCP23327 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HRCP23327 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HRCP23327 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HRCP23327 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
HRCP23327 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HRCP23327 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HRCP23327 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
HRCP23327 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HRCP23327 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HRCP23327 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HRCP23327 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HRCP23327 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms