Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms