Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LIG1P18858 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIG1P18858 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LIG1P18858 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIG1P18858 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIG1P18858 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIG1P18858 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIG1P18858 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIG1P18858 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIG1P18858 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIG1P18858 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIG1P18858 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIG1P18858 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LIG1P18858 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIG1P18858 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIG1P18858 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIG1P18858 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIG1P18858 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIG1P18858 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIG1P18858 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIG1P18858 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIG1P18858 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIG1P18858 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIG1P18858 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIG1P18858 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIG1P18858 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIG1P18858 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIG1P18858 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIG1P18858 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIG1P18858 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIG1P18858 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIG1P18858 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIG1P18858 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIG1P18858 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIG1P18858 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIG1P18858 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIG1P18858 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIG1P18858 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIG1P18858 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIG1P18858 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIG1P18858 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIG1P18858 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIG1P18858 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIG1P18858 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIG1P18858 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIG1P18858 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIG1P18858 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIG1P18858 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIG1P18858 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIG1P18858 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIG1P18858 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIG1P18858 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIG1P18858 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIG1P18858 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIG1P18858 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LIG1P18858 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIG1P18858 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LIG1P18858 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIG1P18858 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIG1P18858 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LIG1P18858 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIG1P18858 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIG1P18858 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIG1P18858 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIG1P18858 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIG1P18858 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIG1P18858 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIG1P18858 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIG1P18858 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LIG1P18858 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIG1P18858 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIG1P18858 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIG1P18858 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIG1P18858 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIG1P18858 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIG1P18858 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIG1P18858 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIG1P18858 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIG1P18858 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIG1P18858 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LIG1P18858 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LIG1P18858 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIG1P18858 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIG1P18858 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIG1P18858 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIG1P18858 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIG1P18858 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIG1P18858 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIG1P18858 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIG1P18858 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIG1P18858 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIG1P18858 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIG1P18858 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIG1P18858 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIG1P18858 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIG1P18858 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIG1P18858 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIG1P18858 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIG1P18858 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIG1P18858 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms