Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA2P17301 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms