Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200.9 ms