Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
F13BP05160 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
F13BP05160 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F13BP05160 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
F13BP05160 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F13BP05160 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
F13BP05160 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
F13BP05160 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
F13BP05160 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
F13BP05160 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
F13BP05160 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
F13BP05160 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
F13BP05160 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F13BP05160 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F13BP05160 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F13BP05160 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F13BP05160 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
F13BP05160 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F13BP05160 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
F13BP05160 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F13BP05160 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F13BP05160 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F13BP05160 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F13BP05160 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F13BP05160 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F13BP05160 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
F13BP05160 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F13BP05160 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
F13BP05160 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F13BP05160 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
F13BP05160 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F13BP05160 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F13BP05160 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
F13BP05160 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
F13BP05160 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
F13BP05160 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F13BP05160 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
F13BP05160 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
F13BP05160 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
F13BP05160 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
F13BP05160 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
F13BP05160 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
F13BP05160 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
F13BP05160 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F13BP05160 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F13BP05160 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
F13BP05160 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F13BP05160 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F13BP05160 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
F13BP05160 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
F13BP05160 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
F13BP05160 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
F13BP05160 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
F13BP05160 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
F13BP05160 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F13BP05160 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
F13BP05160 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F13BP05160 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
F13BP05160 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
F13BP05160 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
F13BP05160 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F13BP05160 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F13BP05160 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F13BP05160 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F13BP05160 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
F13BP05160 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F13BP05160 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
F13BP05160 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F13BP05160 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F13BP05160 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F13BP05160 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
F13BP05160 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
F13BP05160 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
F13BP05160 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F13BP05160 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
F13BP05160 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F13BP05160 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
F13BP05160 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
F13BP05160 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
F13BP05160 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
F13BP05160 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
F13BP05160 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
F13BP05160 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
F13BP05160 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
F13BP05160 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
F13BP05160 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
F13BP05160 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
F13BP05160 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
F13BP05160 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
F13BP05160 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
F13BP05160 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
F13BP05160 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
F13BP05160 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
F13BP05160 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
F13BP05160 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
F13BP05160 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
F13BP05160 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
F13BP05160 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
F13BP05160 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
F13BP05160 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms