Protein–RNA interactions for Protein: P04234

CD3D, T-cell surface glycoprotein CD3 delta chain, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD3DP04234 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD3DP04234 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD3DP04234 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD3DP04234 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD3DP04234 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD3DP04234 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD3DP04234 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD3DP04234 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD3DP04234 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD3DP04234 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD3DP04234 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CD3DP04234 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD3DP04234 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CD3DP04234 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD3DP04234 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD3DP04234 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD3DP04234 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD3DP04234 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD3DP04234 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD3DP04234 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD3DP04234 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD3DP04234 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD3DP04234 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD3DP04234 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD3DP04234 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD3DP04234 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD3DP04234 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD3DP04234 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD3DP04234 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CD3DP04234 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD3DP04234 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD3DP04234 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD3DP04234 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD3DP04234 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD3DP04234 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD3DP04234 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD3DP04234 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD3DP04234 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD3DP04234 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD3DP04234 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD3DP04234 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD3DP04234 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD3DP04234 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD3DP04234 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD3DP04234 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD3DP04234 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD3DP04234 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD3DP04234 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD3DP04234 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CD3DP04234 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD3DP04234 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD3DP04234 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CD3DP04234 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD3DP04234 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CD3DP04234 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CD3DP04234 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD3DP04234 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CD3DP04234 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD3DP04234 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD3DP04234 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD3DP04234 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD3DP04234 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CD3DP04234 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD3DP04234 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD3DP04234 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD3DP04234 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD3DP04234 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD3DP04234 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD3DP04234 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD3DP04234 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD3DP04234 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD3DP04234 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD3DP04234 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD3DP04234 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD3DP04234 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD3DP04234 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD3DP04234 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD3DP04234 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD3DP04234 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD3DP04234 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD3DP04234 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD3DP04234 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD3DP04234 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD3DP04234 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD3DP04234 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD3DP04234 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD3DP04234 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD3DP04234 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD3DP04234 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD3DP04234 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD3DP04234 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD3DP04234 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD3DP04234 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD3DP04234 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD3DP04234 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CD3DP04234 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD3DP04234 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD3DP04234 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD3DP04234 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD3DP04234 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms