Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MYCNP04198 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MYCNP04198 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MYCNP04198 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MYCNP04198 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MYCNP04198 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MYCNP04198 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MYCNP04198 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MYCNP04198 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MYCNP04198 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MYCNP04198 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MYCNP04198 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MYCNP04198 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MYCNP04198 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MYCNP04198 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MYCNP04198 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MYCNP04198 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MYCNP04198 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MYCNP04198 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MYCNP04198 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MYCNP04198 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCNP04198 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCNP04198 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCNP04198 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCNP04198 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCNP04198 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCNP04198 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCNP04198 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCNP04198 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCNP04198 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCNP04198 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCNP04198 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCNP04198 IFNA14-201ENST00000380222 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCNP04198 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCNP04198 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCNP04198 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCNP04198 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCNP04198 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCNP04198 WBP1LP6-201ENST00000438434 424 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCNP04198 AC090527.1-201ENST00000557965 431 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCNP04198 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCNP04198 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCNP04198 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCNP04198 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCNP04198 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCNP04198 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCNP04198 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCNP04198 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCNP04198 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCNP04198 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCNP04198 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCNP04198 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCNP04198 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCNP04198 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCNP04198 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYCNP04198 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCNP04198 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCNP04198 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCNP04198 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCNP04198 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCNP04198 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCNP04198 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCNP04198 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCNP04198 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCNP04198 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCNP04198 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCNP04198 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCNP04198 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCNP04198 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCNP04198 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCNP04198 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCNP04198 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCNP04198 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCNP04198 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCNP04198 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCNP04198 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCNP04198 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCNP04198 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCNP04198 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCNP04198 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCNP04198 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCNP04198 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCNP04198 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCNP04198 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYCNP04198 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYCNP04198 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYCNP04198 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYCNP04198 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYCNP04198 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYCNP04198 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYCNP04198 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYCNP04198 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYCNP04198 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYCNP04198 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYCNP04198 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYCNP04198 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYCNP04198 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYCNP04198 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYCNP04198 IL4-201ENST00000231449 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYCNP04198 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms