Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC1P02654 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC1P02654 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC1P02654 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC1P02654 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC1P02654 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC1P02654 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC1P02654 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC1P02654 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC1P02654 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC1P02654 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC1P02654 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC1P02654 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC1P02654 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC1P02654 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC1P02654 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC1P02654 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC1P02654 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC1P02654 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC1P02654 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC1P02654 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC1P02654 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC1P02654 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC1P02654 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC1P02654 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC1P02654 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC1P02654 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC1P02654 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC1P02654 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC1P02654 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC1P02654 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC1P02654 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC1P02654 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC1P02654 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC1P02654 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC1P02654 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC1P02654 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC1P02654 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC1P02654 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC1P02654 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC1P02654 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC1P02654 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC1P02654 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC1P02654 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC1P02654 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC1P02654 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC1P02654 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC1P02654 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC1P02654 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC1P02654 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC1P02654 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC1P02654 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC1P02654 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC1P02654 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC1P02654 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC1P02654 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC1P02654 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC1P02654 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC1P02654 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC1P02654 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC1P02654 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC1P02654 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC1P02654 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC1P02654 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC1P02654 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC1P02654 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC1P02654 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC1P02654 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC1P02654 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC1P02654 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC1P02654 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC1P02654 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC1P02654 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC1P02654 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC1P02654 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC1P02654 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC1P02654 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC1P02654 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC1P02654 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC1P02654 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC1P02654 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC1P02654 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC1P02654 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC1P02654 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC1P02654 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC1P02654 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC1P02654 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC1P02654 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC1P02654 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC1P02654 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC1P02654 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC1P02654 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC1P02654 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC1P02654 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC1P02654 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC1P02654 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC1P02654 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC1P02654 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC1P02654 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOC1P02654 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms