Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
HLA-HP01893 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-HP01893 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms