Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX58O95786 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX58O95786 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX58O95786 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX58O95786 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX58O95786 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX58O95786 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX58O95786 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX58O95786 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX58O95786 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX58O95786 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX58O95786 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX58O95786 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX58O95786 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX58O95786 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX58O95786 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX58O95786 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX58O95786 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX58O95786 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX58O95786 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX58O95786 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX58O95786 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX58O95786 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX58O95786 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX58O95786 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX58O95786 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX58O95786 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX58O95786 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX58O95786 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX58O95786 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX58O95786 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX58O95786 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX58O95786 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX58O95786 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX58O95786 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX58O95786 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX58O95786 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX58O95786 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX58O95786 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX58O95786 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX58O95786 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX58O95786 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX58O95786 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX58O95786 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX58O95786 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX58O95786 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX58O95786 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX58O95786 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX58O95786 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX58O95786 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX58O95786 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX58O95786 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX58O95786 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX58O95786 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX58O95786 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX58O95786 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX58O95786 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX58O95786 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX58O95786 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX58O95786 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX58O95786 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX58O95786 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX58O95786 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX58O95786 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX58O95786 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX58O95786 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX58O95786 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX58O95786 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX58O95786 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX58O95786 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX58O95786 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX58O95786 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX58O95786 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX58O95786 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX58O95786 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX58O95786 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX58O95786 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX58O95786 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX58O95786 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX58O95786 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX58O95786 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX58O95786 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX58O95786 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX58O95786 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX58O95786 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX58O95786 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX58O95786 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX58O95786 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX58O95786 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX58O95786 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX58O95786 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX58O95786 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX58O95786 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX58O95786 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX58O95786 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX58O95786 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX58O95786 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX58O95786 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX58O95786 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX58O95786 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms