Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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