Protein–RNA interactions for Protein: O75365

PTP4A3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A3O75365 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms