Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIN3BO75182 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms