Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SRGAP3O43295 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
SRGAP3O43295 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SRGAP3O43295 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SRGAP3O43295 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRGAP3O43295 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRGAP3O43295 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRGAP3O43295 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SRGAP3O43295 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRGAP3O43295 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRGAP3O43295 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRGAP3O43295 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRGAP3O43295 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRGAP3O43295 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRGAP3O43295 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRGAP3O43295 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRGAP3O43295 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRGAP3O43295 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRGAP3O43295 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRGAP3O43295 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRGAP3O43295 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRGAP3O43295 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRGAP3O43295 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRGAP3O43295 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SRGAP3O43295 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRGAP3O43295 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRGAP3O43295 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRGAP3O43295 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRGAP3O43295 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRGAP3O43295 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRGAP3O43295 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRGAP3O43295 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRGAP3O43295 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRGAP3O43295 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRGAP3O43295 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRGAP3O43295 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRGAP3O43295 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SRGAP3O43295 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRGAP3O43295 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SRGAP3O43295 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms