Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNMO15061 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNMO15061 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNMO15061 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNMO15061 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNMO15061 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNMO15061 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNMO15061 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNMO15061 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNMO15061 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNMO15061 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNMO15061 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNMO15061 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNMO15061 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNMO15061 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNMO15061 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNMO15061 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNMO15061 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNMO15061 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNMO15061 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNMO15061 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNMO15061 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNMO15061 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNMO15061 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNMO15061 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNMO15061 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNMO15061 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNMO15061 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNMO15061 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNMO15061 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNMO15061 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNMO15061 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNMO15061 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNMO15061 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNMO15061 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNMO15061 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNMO15061 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNMO15061 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNMO15061 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNMO15061 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNMO15061 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNMO15061 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNMO15061 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNMO15061 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNMO15061 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNMO15061 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNMO15061 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNMO15061 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNMO15061 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNMO15061 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNMO15061 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNMO15061 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNMO15061 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNMO15061 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNMO15061 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNMO15061 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNMO15061 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNMO15061 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNMO15061 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNMO15061 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNMO15061 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNMO15061 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNMO15061 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNMO15061 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNMO15061 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNMO15061 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNMO15061 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNMO15061 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNMO15061 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNMO15061 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNMO15061 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNMO15061 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNMO15061 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNMO15061 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNMO15061 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNMO15061 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNMO15061 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNMO15061 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNMO15061 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNMO15061 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNMO15061 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNMO15061 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNMO15061 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNMO15061 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNMO15061 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNMO15061 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNMO15061 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNMO15061 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNMO15061 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNMO15061 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNMO15061 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNMO15061 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNMO15061 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNMO15061 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNMO15061 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNMO15061 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNMO15061 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNMO15061 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNMO15061 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNMO15061 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms