Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SETD1AO15047 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms