Protein–RNA interactions for Protein: E5RI56

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E5RI56 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E5RI56 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E5RI56 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E5RI56 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E5RI56 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E5RI56 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
E5RI56 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E5RI56 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E5RI56 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E5RI56 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E5RI56 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E5RI56 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E5RI56 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
E5RI56 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E5RI56 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E5RI56 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E5RI56 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E5RI56 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
E5RI56 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E5RI56 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E5RI56 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E5RI56 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E5RI56 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E5RI56 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E5RI56 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E5RI56 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E5RI56 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E5RI56 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E5RI56 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E5RI56 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E5RI56 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E5RI56 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E5RI56 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E5RI56 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E5RI56 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E5RI56 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E5RI56 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E5RI56 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E5RI56 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E5RI56 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E5RI56 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E5RI56 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E5RI56 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E5RI56 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E5RI56 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E5RI56 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E5RI56 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E5RI56 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E5RI56 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E5RI56 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E5RI56 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E5RI56 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E5RI56 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E5RI56 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E5RI56 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E5RI56 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E5RI56 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E5RI56 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E5RI56 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E5RI56 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E5RI56 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E5RI56 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E5RI56 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E5RI56 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E5RI56 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E5RI56 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E5RI56 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E5RI56 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E5RI56 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E5RI56 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E5RI56 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E5RI56 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E5RI56 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
E5RI56 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E5RI56 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E5RI56 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E5RI56 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E5RI56 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E5RI56 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E5RI56 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E5RI56 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E5RI56 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E5RI56 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E5RI56 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E5RI56 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E5RI56 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
E5RI56 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E5RI56 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E5RI56 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E5RI56 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E5RI56 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E5RI56 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
E5RI56 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
E5RI56 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E5RI56 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E5RI56 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
E5RI56 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E5RI56 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E5RI56 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
E5RI56 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms