Protein–RNA interactions for Protein: D6REC4

CFAP99, Cilia- and flagella-associated protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP99D6REC4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP99D6REC4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms