Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4DXG7 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4DXG7 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4DXG7 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4DXG7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4DXG7 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4DXG7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4DXG7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4DXG7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4DXG7 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4DXG7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4DXG7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4DXG7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4DXG7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4DXG7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4DXG7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4DXG7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
B4DXG7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4DXG7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4DXG7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4DXG7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4DXG7 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4DXG7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4DXG7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4DXG7 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4DXG7 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4DXG7 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4DXG7 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4DXG7 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4DXG7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DXG7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DXG7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DXG7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DXG7 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DXG7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DXG7 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DXG7 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DXG7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DXG7 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DXG7 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DXG7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DXG7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DXG7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DXG7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DXG7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DXG7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DXG7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DXG7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DXG7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DXG7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DXG7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DXG7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DXG7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DXG7 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DXG7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DXG7 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DXG7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DXG7 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DXG7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DXG7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DXG7 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DXG7 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DXG7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DXG7 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DXG7 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DXG7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DXG7 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DXG7 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DXG7 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DXG7 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DXG7 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DXG7 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DXG7 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DXG7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DXG7 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DXG7 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DXG7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DXG7 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DXG7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DXG7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DXG7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DXG7 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DXG7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DXG7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DXG7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DXG7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DXG7 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DXG7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DXG7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DXG7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DXG7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DXG7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DXG7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DXG7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DXG7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DXG7 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DXG7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DXG7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DXG7 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DXG7 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms