Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms