Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms