Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms