Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms