Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms