Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms