Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms