Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FARSAQ9Y285 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FARSAQ9Y285 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FARSAQ9Y285 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FARSAQ9Y285 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FARSAQ9Y285 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FARSAQ9Y285 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
FARSAQ9Y285 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FARSAQ9Y285 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FARSAQ9Y285 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FARSAQ9Y285 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FARSAQ9Y285 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FARSAQ9Y285 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FARSAQ9Y285 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FARSAQ9Y285 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FARSAQ9Y285 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FARSAQ9Y285 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FARSAQ9Y285 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FARSAQ9Y285 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FARSAQ9Y285 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FARSAQ9Y285 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FARSAQ9Y285 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FARSAQ9Y285 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FARSAQ9Y285 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FARSAQ9Y285 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FARSAQ9Y285 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FARSAQ9Y285 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FARSAQ9Y285 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FARSAQ9Y285 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FARSAQ9Y285 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms