Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms