Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MRTO4Q9UKD2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms