Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms