Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
POLKQ9UBT6 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms