Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVS9

PNPO, Pyridoxine-5'-phosphate oxidase, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPOQ9NVS9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PNPOQ9NVS9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms