Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH6

TMLHE, Trimethyllysine dioxygenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMLHEQ9NVH6 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TMLHEQ9NVH6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMLHEQ9NVH6 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMLHEQ9NVH6 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMLHEQ9NVH6 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMLHEQ9NVH6 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMLHEQ9NVH6 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TMLHEQ9NVH6 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMLHEQ9NVH6 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TMLHEQ9NVH6 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMLHEQ9NVH6 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMLHEQ9NVH6 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TMLHEQ9NVH6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMLHEQ9NVH6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMLHEQ9NVH6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TMLHEQ9NVH6 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMLHEQ9NVH6 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMLHEQ9NVH6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMLHEQ9NVH6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMLHEQ9NVH6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMLHEQ9NVH6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TMLHEQ9NVH6 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms