Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 ELL2P2-201ENST00000515135 694 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 AL157871.5-201ENST00000555212 533 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 AC010618.2-201ENST00000596192 460 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 MAPK10-379ENST00000642013 1385 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FOXD4L1Q9NU39 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 AC115102.1-201ENST00000558044 487 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD4L1Q9NU39 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms