Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms