Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms