Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMMDC1Q9NPL8 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms