Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI1

BRD7, Bromodomain-containing protein 7, humanhuman

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Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD7Q9NPI1 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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BRD7Q9NPI1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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BRD7Q9NPI1 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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BRD7Q9NPI1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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BRD7Q9NPI1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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BRD7Q9NPI1 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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BRD7Q9NPI1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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BRD7Q9NPI1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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BRD7Q9NPI1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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BRD7Q9NPI1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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BRD7Q9NPI1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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BRD7Q9NPI1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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BRD7Q9NPI1 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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