Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRDE2Q9H7Z3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms