Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
C20orf27Q9GZN8 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
C20orf27Q9GZN8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
C20orf27Q9GZN8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
C20orf27Q9GZN8 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
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C20orf27Q9GZN8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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C20orf27Q9GZN8 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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C20orf27Q9GZN8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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C20orf27Q9GZN8 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
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C20orf27Q9GZN8 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
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C20orf27Q9GZN8 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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C20orf27Q9GZN8 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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C20orf27Q9GZN8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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C20orf27Q9GZN8 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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C20orf27Q9GZN8 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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C20orf27Q9GZN8 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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C20orf27Q9GZN8 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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C20orf27Q9GZN8 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C20orf27Q9GZN8 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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