Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCAPERQ9BY12 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms