Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms