Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms