Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms